Konsentrasi pada mikroorganisme seperti bakteri, jamur, alga, dan protista. Dalam konteks lokal, mikroba dari ekosistem gambut atau lahan basah tropis dapat menjadi fokus riset sebagai agen bioteknologi — misalnya dalam pengolahan limbah, produksi metabolit, atau bioremediasi. Beberapa contoh kajian di bidang mikrobiologi misalnya bakteri indigenous tanah gambut, bakteri pada limbah sludge sawit, potensi jamur dan bakteri sebagai biofertilizer.